按照集装箱运输方式一般分为铁路集装箱运输、海运集装箱运输和集装箱公路运输。铁路集装箱运输，多接40尺柜，不接特种柜运输，如果是20GP需要配对，2x20GP。集装箱海运运输，以海运的方式，通过船舶。集装箱公路运输，一般使用集装箱卡车运输的方式，可以运输单个20GP/40GP/HQ/FR/RF/OT等，也可以单辆车运输2x20GP，通常我们所说的“双拖”“双背”。这种运输需要注意两个箱子的重量不能相差太大，箱门需要按照相反方向装车，即一边门在车尾，另一个门在靠车头驾驶室位置。

整箱运输（FULL CONTAINER TRANSPORT, FCL）：

一只集装箱里只有一个货主的货物和一个目的地。当然也有例外，里面有2个以上的，比较少，像这样的一般是1份MBL对应一份HBL和箱单发票。

拼箱运输（LESS THAN ONE CONTAINER TRANSPORT,LCL）：

单个集装箱里有2个及两个以上货主托运的货物，不同的货物性质和目的地。